از دیگر مزایای استفاده از MRI در تشخیص،مشاهده ی روند درمان،و پیگیری بیماران مبتلا به MS، ارتباط بین نشانه های کلینیکی و مشاهدات رادیولوژی از آبنورمالی های پاتولوژیکی که نامشخص باقیمانده، می باشد.

تمام بیمارانی که از دیگر بیماری ها به جزMS ،یا بیماری های وابسته به آن ، یا بیمارانی که اندیکاسیونی برای MRI ندارند،خارج از این تحقیق قرار دارند.

تغییرات ماده ی خاکستری و ماده سفید به وسیله ی  3D T1-weighted و Diffusion-tensor imaging sequences و به وسیله ی به کار گیری   voxel-based morphometry(VBM)و آنالیز های Tract-based spatial statistics(TBSS) ،به تصویر کشیده شد.VBM و TBSS برای آنالیز ماده خاکستری و  ماده سفید  و ناهمسانی های جزیی ماده سفید، کاربرد دارد.

آنالیز مطالعه از بعد طولی،  کاهش قابل توجهی را در کل سطح ماده ی خاکستری نشان میدهد. در حالیکه آنالیزVBM  گسترش آتروفی در ناحیه ی ماده خاکستری را در بیشتر مناطق کورتیکال و ساب کورتیکال در هر دو نیم کره ی مغزی نشان می دهد.هیچ تغیر قابل مشاهده ی طولی به صورت کلی یا ناحیه ای در ماده ی سفید،دیده نشد.

آتروفی ماده ی خاکستری،به طور واضحی در طول سال اول ،بعد از بروز بیماری،افزایش می یابد،در حالیکه آسیب های ماده ی سفید که از ابتدا وجود داشته است،تغییر قابل مشاهده ای در زمان مشابه نداشته است.

سطوح مختلف  آسیب های ماده سفید و خاکستری به صورت مرکب، به عنوان برخی تغییرات خطرناک در بیماران مبتلا به MS، محسوب می شود.